Z kotłów tradycyjnych (atmosferycznych), spaliny odprowadzane są przez komin murowany (zabezpieczony wkładem ze stali nierdzewnej) lub prefabrykowany. Natomiast kotły kondensacyjne, ze względu na inną budowę, nie wymagają standardowego komina. Napływ powietrza potrzebnego do spalania gazu i wypływ spalin do atmosfery zapewniają specjalne systemy powietrzno-spalinowe. Sprzedawane są zarówno przez producentów kotłów, jak i niezależnych producentów kominów.

Aby system kominowy właściwie i bezpiecznie współpracował z gazowym kotłem kondensacyjnym, powinien:

- być wykonany z materiałów odpornych na działanie kwaśnego kondensatu i dostosowany do temperatury spalin;

- mieć elementy systemu szczelnie połączone (między nimi muszą znaleźć się uszczelki), aby kondensat spływający po wewnętrznych ściankach przewodu kominowego oraz spaliny nie wydostały się na zewnątrz;

- mieć średnicę komina dobraną do ciśnienia wytwarzanego przez wentylator wymuszający wypływ spalin z kotła, planowanej długości przewodu spalinowego oraz ilości spalin i ich temperatury;

- elementy komina znajdujące się na zewnątrz domu muszą być odporne na działanie promieniowania UV.

Inwestor ma do wyboru różne rodzaje systemów powietrzno-spalinowych: koncentryczny (poziomy lub pionowy), rozdzielny bądź szachtowy. Gdy komin jest już wybudowany, ten ostatni rodzaj będzie najtańszym rozwiązaniem. Polega na włożeniu do komina wkładu, na przykład ze stali nierdzewnej, w którym poszczególne odcinki są zabezpieczone uszczelkami. Rurą tą będą usuwane spaliny, a powietrze do spalania dopłynie przestrzenią pomiędzy metalowym wkładem a murowanym kominem.